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蛋白质组学助力鸿运国际阿尔茨海默症诊断标志物筛选

发布时间:2025-02-12   信息来源:甄亮泰

阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)是一种隐匿发病、逐渐加重的神经退行性疾病,其主要病理特征为β淀粉样蛋白(Aβ)斑块的形成和神经原纤维缠结(NFTs)(Knopman DS, et al. 2021)。AD患者通常表现出渐进性的认知能力下降,包括记忆力衰退、语言功能障碍、执行能力下降和注意力不集中,严重影响其社交、职业和日常生活功能。AD不仅对患者造成了灾难性的影响,也给家庭和社会带来了沉重的经济负担和照料压力。当前,诊断AD主要依赖于脑脊液中Aβ、Tau和p-Tau蛋白水平的检测,以及脑部PET-CT检查。然而,由于脑脊液采集涉及侵入性,患者的接受度较低;此外,PET-CT检查费用高昂,导致其在早期患者及无症状人群中的广泛应用受到限制。因此,研发便捷的AD早期诊断方法成为该领域的一大瓶颈。

蛋白质组学助力鸿运国际阿尔茨海默症诊断标志物筛选

2024年1月2日,浙江大学吴志英团队在《Cell》子刊《The Innovation》(IF:332)上发表了一篇题为“Alzheimer’s disease early diagnostic and staging biomarkers revealed by large-scale cerebrospinal fluid and serum proteomic profiling”的研究文章。该研究通过收集AD患者的脑脊液(CSF)和血清样本进行蛋白质组分析,利用机器学习模型开发了用于AD早期诊断的包含19种脑脊液蛋白和8种血清蛋白的面板。同时,验证了21种核心的AD阶段依赖性差异蛋白,并分析了这些蛋白作为识别AD早期诊断和分期生物标志物的潜力。

研究结果表明,作者通过对发现队列中AD样本与对照样本进行TMT蛋白质组分析,在190种差异蛋白中识别出167种表达上调和4种表达下调的蛋白,最终确定其可以作为AD诱导的轻度认知障碍(MCI)患者的CSF诊断标志物。进一步的Ingenuity途径分析显示,细胞外基质(ECM)代谢在AD的发病机制中起着关键作用。

为了验证发现队列中的差异蛋白,作者在独立的多中心队列中进行平行反应监测(PRM),验证了57种脑脊液差异蛋白和12种血清差异蛋白的表达。此外,为了探索利用差异蛋白区分AD诱导的MCI与正常对照(CN),作者采用随机森林机器学习模型,在MCI和CN的CSF蛋白质组学数据中识别出含19种蛋白的面板,显示出极高的准确性(AUC = 0.984)。文献检索还发现,这19种差异蛋白中有数种与AD的发生密切相关。

在研究的后续阶段,作者分析了19种CSF早期诊断生物标志物与Aβ42、Tau和p-Tau水平的相关性,发现多种生物标志物与这些关键蛋白水平均有相关性。这表明,AD的进展不仅受到Aβ和p-Tau的影响,还涉及到复杂的分子途径。

此外,作者还识别出AD不同阶段(轻度、中度和重度)的差异蛋白,并进行信号通路分析,发现与胰岛素、钙依赖性蛋白激酶II和微管相关蛋白Tau(MAPT)相关的信号通路。这些发现不仅为理解AD的病理机制提供了新的视角,也为临床早期筛查与分期提供了潜在的生物标志物。

总结来说,作者的研究通过蛋白质组学分析,成功开发出针对AD早期分期和诊断的生物标志物。基于机器学习的CSF和血清面板的建立,将为未来临床AD筛查提供数据基础。该研究成果不仅具有学术价值,还为广大的AD患者群体带来希望,同时也凸显了鸿运国际在推动生物医学研究领域的重要作用。