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超越传统模型:鸿运国际SomaScan小队列巨大发现,打造肝癌早期预测新标志物!

发布时间:2025-02-15   信息来源:池才燕

与许多其他癌症相比,肝癌,尤其是肝细胞癌(HCC)的发病率更高。由于早期HCC通常无明显症状,大部分患者在确诊时已处于晚期状态,目前尚缺乏针对早期肝细胞癌的有效监测策略。因此,鉴定与HCC相关的潜在早期生物标志物显得尤为重要。

超越传统模型:鸿运国际SomaScan小队列巨大发现,打造肝癌早期预测新标志物!

2024年8月,美国布莱根妇女医院的研究团队在《Journal of the National Cancer Institute》上发表了题为“预诊断血浆蛋白质组学特征与肝细胞癌相关性”的研究论文。该研究利用SomaScan平台,对108名HCC患者及对照组的血浆蛋白进行了靶向高通量检测,最终确定了56种可能作为肝细胞癌生物标志物的蛋白,并基于其中四种蛋白建立了一个预测模型,显示出优于传统模型的预测性能。

研究材料

该研究使用了护士健康研究(NHS)和卫生专业人员随访研究(HPFS)两个队列中的54对HCC患者及基线匹配的无肝病对照血浆,以及来自英国生物样本库制药蛋白组学项目(UKB-PPP)的验证队列的血浆样本。

技术路线

  1. 识别与HCC相关的预诊断差异表达蛋白。
  2. 对区分HCC患者与健康对照的预诊断失调蛋白进行系统生物学分析。
  3. 通过ELISA技术对筛选的蛋白质进行验证。
  4. 利用Olink技术对选定的蛋白进行独立验证。

研究结果

该研究首先鉴定出了与HCC相关的差异表达诊断蛋白。在NHS/HPFS队列中,SomaScan分析的1305种蛋白中,有121种蛋白在HCC组和非HCC组中的表达水平显著不同。其中,56种蛋白在HCC患者中表达上调。

接下来研究团队进行了系统生物学分析,以探讨与HCC发生相关的生物机制,结果显示这56种蛋白的生物功能涉及炎症过程、免疫功能、细胞活性及活性氧的合成。同时,使用STRING数据库进行了蛋白质相互作用网络分析,确定了与水解、粘附、血管功能、代谢等相关的互作网络。

利用免疫测定程序,进一步对选定的CHI3L1、GDF15、SELE及IL1RN四种蛋白进行验证。这些蛋白的表达水平在HCC患者中与正常对照组的差异得到一致确认,且与HCC风险呈正相关。研究建立的逻辑回归模型显示,基于这四种蛋白的AUC为0.83,明显高于传统模型的0.67。

此外,UKB-PPP队列中的Olink验证结果表明,这四种蛋白均与HCC呈正相关,逻辑回归模型的AUC提升至0.88。研究还发现,在62名肝硬化患者中,有5人在随访期间发展为HCC,而这些患者的CHI3L1和GDF15水平显著高于非HCC组。

总结

本研究通过SomaScan高通量靶向蛋白组学技术,成功筛选出了56种与HCC发展相关的血浆蛋白。这些经ELISA及Olink验证的生物标志物,能够显著提高传统模型的预测能力,为肝细胞癌的早期检测和管理提供了希望。

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