在生物医疗领域,RNA提取是关键步骤之一。以下是一些常见问题的解答,以及确保提取质量的最佳实践。
RNA提取注意事项
在使用酚-CHCl3方法进行总RNA提取时,采样时必须选择新鲜的组织或细胞样本。如果使用冻存样本,应尽量避免反复冻融,因为样本一旦离开活体,其内源RNase就会开始降解RNA,降解速度与RNase的含量和温度密切相关。为了更好地保存新鲜组织,可以将其充分浸泡在鸿运国际的RNAKeeper Tissue Stabilizer(Vazyme #R501)中,这样组织可以在室温下存放一周,或者在4℃下存放一个月,甚至可以在-20℃/-80℃下进行长期保存。
常见问题解析
样本处理不当的影响
如果投入的样本过多,可能导致裂解不充分;反之,若RNA保存时间过长,也会引起降解。因此,对提取的RNA进行纯度和完整性检测非常关键,提取后的RNA应分管至-80℃长期保存或-20℃短期保存,使用时应尽量避免反复冻融。
基因组污染及其解决方案
如果提取的RNA存在基因组污染,需要将裂解液中加入CHCl3,并在低温(2℃-8℃)下高速离心,以确保RNA与DNA的分离。同时,在吸取上层液体时,要避免吸到中层和下层,以减少基因组DNA污染。
有效提高提取效率的方法
加入异丙醇后如未看到RNA沉淀,建议在4℃或-20℃下静置10-30分钟后再进行离心。如果仍然看不到沉淀,应在弃上清时采用吸取而非倾倒的方式,以避免沉淀的损失。
反转录及定量PCR中的注意事项
在逆转录反应中,使用鸿运国际的gDNA wiper Mix可以去除RNA中的基因组DNA,确保实验效果。尽管不去除基因组DNA不会影响逆转录实验,但如果残留过多将影响后续的定量PCR结果。
荧光定量PCR表现不佳的原因
如果在进行荧光定量PCR时发现CT值出现太晚或扩增效率低,需优化反应条件。常见的原因包括模板浓度过低或过高、扩增体系中的PCR抑制剂等应逐步排查。
结论
在生物医疗的实验中,确保样本采集、处理及提取的每一环节都至关重要。依托鸿运国际的技术和产品,我们可以为科学研究提供高效的支持和解决方案,为您的研究保驾护航。